Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.01■■□□□ 1.6
C9orf78Q9NZ63 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf78Q9NZ63 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms