Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GINM1Q9NU53 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GINM1Q9NU53 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms