Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH2B1Q9NRF2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH2B1Q9NRF2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms