Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASS4Q9NQ75 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CASS4Q9NQ75 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms