Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BCAS3Q9H6U6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BCAS3Q9H6U6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms