Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PUS3Q9BZE2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms