Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CELF4Q9BZC1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CELF4Q9BZC1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms