Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NDC1Q9BTX1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NDC1Q9BTX1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms