Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIOK1Q9BRS2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIOK1Q9BRS2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms