Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK5RAP2Q96SN8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP2Q96SN8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms