Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN18Q96SJ8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms