Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC43Q96MW1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC43Q96MW1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms