Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRRC1Q96M27 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRRC1Q96M27 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms