Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLMNQ96JQ2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLMNQ96JQ2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLMNQ96JQ2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms