Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC136Q96JN2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC136Q96JN2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms