Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK5RAP3Q96JB5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK5RAP3Q96JB5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms