Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BORCS6Q96GS4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS6Q96GS4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms