Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM12Q96EX1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms