Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATG4CQ96DT6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms