Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCC1Q96CN9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GCC1Q96CN9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms