Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLUAP1Q96AJ1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms