Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGGTAQ92696 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGGTAQ92696 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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