Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAAF4Q8WXU2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAAF4Q8WXU2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms