Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM41Q8WV44 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms