Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2AF1L4Q8WU68 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms