Protein–RNA interactions for Protein: Q8TGS9

YMR001C-A, Uncharacterized protein YMR001C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AQ8TGS9 YEL014CYEL014C 306 nt-2.32□□□□□ -2.78
YMR001C-AQ8TGS9 YER006C-AYER006C-A 318 nt-2.34□□□□□ -2.78
YMR001C-AQ8TGS9 YNL028WYNL028W 318 nt-2.35□□□□□ -2.79
YMR001C-AQ8TGS9 YPR197CYPR197C 564 nt-2.35□□□□□ -2.79
YMR001C-AQ8TGS9 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt-2.36□□□□□ -2.79
YMR001C-AQ8TGS9 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt-2.37□□□□□ -2.79
YMR001C-AQ8TGS9 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-2.37□□□□□ -2.79
YMR001C-AQ8TGS9 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt-2.39□□□□□ -2.79
YMR001C-AQ8TGS9 YPR012WYPR012W 255 nt-2.39□□□□□ -2.79
YMR001C-AQ8TGS9 snR41snR41 95 nt-2.39□□□□□ -2.79
YMR001C-AQ8TGS9 snR78snR78 87 nt-2.43□□□□□ -2.8
YMR001C-AQ8TGS9 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt-2.43□□□□□ -2.8
YMR001C-AQ8TGS9 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt-2.43□□□□□ -2.8
YMR001C-AQ8TGS9 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt-2.46□□□□□ -2.8
YMR001C-AQ8TGS9 snR6snR6 112 nt-2.47□□□□□ -2.8
YMR001C-AQ8TGS9 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt-2.48□□□□□ -2.81
YMR001C-AQ8TGS9 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt-2.49□□□□□ -2.81
YMR001C-AQ8TGS9 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt-2.49□□□□□ -2.81
YMR001C-AQ8TGS9 snR55snR55 98 nt-2.53□□□□□ -2.81
YMR001C-AQ8TGS9 HTL1YCR020W-B 237 nt-2.53□□□□□ -2.81
YMR001C-AQ8TGS9 YER181CYER181C 324 nt-2.53□□□□□ -2.81
YMR001C-AQ8TGS9 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt-2.55□□□□□ -2.82
YMR001C-AQ8TGS9 STE18YJR086W 333 nt-2.56□□□□□ -2.82
YMR001C-AQ8TGS9 snR73snR73 106 nt-2.58□□□□□ -2.82
YMR001C-AQ8TGS9 YNL122CYNL122C 348 nt-2.58□□□□□ -2.82
YMR001C-AQ8TGS9 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-2.58□□□□□ -2.82
YMR001C-AQ8TGS9 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt-2.59□□□□□ -2.82
YMR001C-AQ8TGS9 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-2.6□□□□□ -2.83
YMR001C-AQ8TGS9 YDR413CYDR413C 576 nt-2.61□□□□□ -2.83
YMR001C-AQ8TGS9 BIL1YOR304C-A 231 nt-2.61□□□□□ -2.83
YMR001C-AQ8TGS9 YKL123WYKL123W 381 nt-2.65□□□□□ -2.83
YMR001C-AQ8TGS9 Q0142Q0142 177 nt-2.66□□□□□ -2.84
YMR001C-AQ8TGS9 snR80snR80 171 nt-2.67□□□□□ -2.84
YMR001C-AQ8TGS9 YJL150WYJL150W 303 nt-2.68□□□□□ -2.84
YMR001C-AQ8TGS9 Q0255Q0255 1419 nt-2.68□□□□□ -2.84
YMR001C-AQ8TGS9 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.7□□□□□ -2.84
YMR001C-AQ8TGS9 YOR102WYOR102W 351 nt-2.7□□□□□ -2.84
YMR001C-AQ8TGS9 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-2.72□□□□□ -2.84
YMR001C-AQ8TGS9 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt-2.72□□□□□ -2.84
YMR001C-AQ8TGS9 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt-2.72□□□□□ -2.84
YMR001C-AQ8TGS9 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt-2.73□□□□□ -2.85
YMR001C-AQ8TGS9 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt-2.75□□□□□ -2.85
YMR001C-AQ8TGS9 RPL41BYDL133C-A 78 nt-2.78□□□□□ -2.85
YMR001C-AQ8TGS9 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt-2.79□□□□□ -2.86
YMR001C-AQ8TGS9 snR48snR48 113 nt-2.8□□□□□ -2.86
YMR001C-AQ8TGS9 YKL118WYKL118W 312 nt-2.81□□□□□ -2.86
YMR001C-AQ8TGS9 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt-2.81□□□□□ -2.86
YMR001C-AQ8TGS9 GIM4YEL003W 336 nt-2.86□□□□□ -2.87
YMR001C-AQ8TGS9 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt-2.86□□□□□ -2.87
YMR001C-AQ8TGS9 YGR035CYGR035C 351 nt-2.87□□□□□ -2.87
YMR001C-AQ8TGS9 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt-2.91□□□□□ -2.88
YMR001C-AQ8TGS9 snR38snR38 95 nt-2.92□□□□□ -2.88
YMR001C-AQ8TGS9 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt-2.92□□□□□ -2.88
YMR001C-AQ8TGS9 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt-2.93□□□□□ -2.88
YMR001C-AQ8TGS9 RPL41AYDL184C 78 nt-2.94□□□□□ -2.88
YMR001C-AQ8TGS9 YNL337WYNL337W 255 nt-3.02□□□□□ -2.89
YMR001C-AQ8TGS9 YNR025CYNR025C 360 nt-3.05□□□□□ -2.9
YMR001C-AQ8TGS9 YJR162CYJR162C 351 nt-3.06□□□□□ -2.9
YMR001C-AQ8TGS9 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt-3.07□□□□□ -2.9
YMR001C-AQ8TGS9 snR56snR56 88 nt-3.08□□□□□ -2.9
YMR001C-AQ8TGS9 YNL198CYNL198C 303 nt-3.09□□□□□ -2.9
YMR001C-AQ8TGS9 snR87snR87 109 nt-3.12□□□□□ -2.91
YMR001C-AQ8TGS9 snR52snR52 92 nt-3.12□□□□□ -2.91
YMR001C-AQ8TGS9 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt-3.14□□□□□ -2.91
YMR001C-AQ8TGS9 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt-3.14□□□□□ -2.91
YMR001C-AQ8TGS9 YOR302WYOR302W 78 nt-3.14□□□□□ -2.91
YMR001C-AQ8TGS9 snR85snR85 171 nt-3.22□□□□□ -2.92
YMR001C-AQ8TGS9 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-3.22□□□□□ -2.92
YMR001C-AQ8TGS9 RPL39YJL189W 156 nt-3.23□□□□□ -2.93
YMR001C-AQ8TGS9 SOM1YEL059C-A 225 nt-3.24□□□□□ -2.93
YMR001C-AQ8TGS9 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-3.27□□□□□ -2.93
YMR001C-AQ8TGS9 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt-3.28□□□□□ -2.93
YMR001C-AQ8TGS9 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt-3.32□□□□□ -2.94
YMR001C-AQ8TGS9 snR47snR47 99 nt-3.32□□□□□ -2.94
YMR001C-AQ8TGS9 YBL053WYBL053W 375 nt-3.39□□□□□ -2.95
YMR001C-AQ8TGS9 YGR151CYGR151C 336 nt-3.4□□□□□ -2.95
YMR001C-AQ8TGS9 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-3.4□□□□□ -2.95
YMR001C-AQ8TGS9 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt-3.44□□□□□ -2.96
YMR001C-AQ8TGS9 SPG3YDR504C 384 nt-3.45□□□□□ -2.96
YMR001C-AQ8TGS9 YKL225WYKL225W 348 nt-3.52□□□□□ -2.97
YMR001C-AQ8TGS9 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt-3.54□□□□□ -2.98
YMR001C-AQ8TGS9 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-3.54□□□□□ -2.98
YMR001C-AQ8TGS9 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt-3.56□□□□□ -2.98
YMR001C-AQ8TGS9 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt-3.57□□□□□ -2.98
YMR001C-AQ8TGS9 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt-3.58□□□□□ -2.98
YMR001C-AQ8TGS9 YDR157WYDR157W 402 nt-3.62□□□□□ -2.99
YMR001C-AQ8TGS9 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt-3.62□□□□□ -2.99
YMR001C-AQ8TGS9 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt-3.63□□□□□ -2.99
YMR001C-AQ8TGS9 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt-3.64□□□□□ -2.99
YMR001C-AQ8TGS9 snR58snR58 96 nt-3.68□□□□□ -3
YMR001C-AQ8TGS9 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-3.75□□□□□ -3.01
YMR001C-AQ8TGS9 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt-3.76□□□□□ -3.01
YMR001C-AQ8TGS9 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.76□□□□□ -3.01
YMR001C-AQ8TGS9 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-3.77□□□□□ -3.01
YMR001C-AQ8TGS9 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt-3.8□□□□□ -3.02
YMR001C-AQ8TGS9 snR65snR65 100 nt-3.82□□□□□ -3.02
YMR001C-AQ8TGS9 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt-3.93□□□□□ -3.04
YMR001C-AQ8TGS9 YNL170WYNL170W 396 nt-4.02□□□□□ -3.05
YMR001C-AQ8TGS9 Q0017Q0017 162 nt-4.12□□□□□ -3.07
YMR001C-AQ8TGS9 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-4.13□□□□□ -3.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms