Protein–RNA interactions for Protein: Q8TGK1

YHR213W-B, Uncharacterized protein YHR213W-B, yeast

Predictions only

Length 99 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR213W-B	Q8TGK1	snR39B	snR39B	96 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
YHR213W-B	Q8TGK1	YDR413C	YDR413C	576 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
YHR213W-B	Q8TGK1	PMP2	YEL017C-A	132 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
YHR213W-B	Q8TGK1	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
YHR213W-B	Q8TGK1	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	YGR146C-A	YGR146C-A	162 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	YOR329W-A	YOR329W-A	210 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	SKI7	YOR076C	2244 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	VAR1	Q0140	1197 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	snR161	snR161	161 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	YER181C	YER181C	324 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
YHR213W-B	Q8TGK1	YKL118W	YKL118W	312 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
YHR213W-B	Q8TGK1	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
YHR213W-B	Q8TGK1	RPL39	YJL189W	156 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
YHR213W-B	Q8TGK1	tD(GUC)Q	tD(GUC)Q	75 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
YHR213W-B	Q8TGK1	snR67	snR67	82 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
YHR213W-B	Q8TGK1	YLR286W-A	YLR286W-A	135 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
YHR213W-B	Q8TGK1	YBR178W	YBR178W	375 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
YHR213W-B	Q8TGK1	snR55	snR55	98 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
YHR213W-B	Q8TGK1	YOR302W	YOR302W	78 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
YHR213W-B	Q8TGK1	YPR012W	YPR012W	255 nt		-1	□□□□□ -2.57
YHR213W-B	Q8TGK1	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1	□□□□□ -2.57
YHR213W-B	Q8TGK1	YDL159C-B	YDL159C-B	177 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
YHR213W-B	Q8TGK1	GIM4	YEL003W	336 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
YHR213W-B	Q8TGK1	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
YHR213W-B	Q8TGK1	YNL205C	YNL205C	423 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
YHR213W-B	Q8TGK1	YML054C-A	YML054C-A	159 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YHR213W-B	Q8TGK1	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YHR213W-B	Q8TGK1	snR48	snR48	113 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
YHR213W-B	Q8TGK1	snR77	snR77	88 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
YHR213W-B	Q8TGK1	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
YHR213W-B	Q8TGK1	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
YHR213W-B	Q8TGK1	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
YHR213W-B	Q8TGK1	Q0144	Q0144	330 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
YHR213W-B	Q8TGK1	snR52	snR52	92 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
YHR213W-B	Q8TGK1	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
YHR213W-B	Q8TGK1	snR65	snR65	100 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
YHR213W-B	Q8TGK1	YOR102W	YOR102W	351 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
YHR213W-B	Q8TGK1	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
YHR213W-B	Q8TGK1	snR80	snR80	171 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
YHR213W-B	Q8TGK1	YGR240C-A	YGR240C-A	201 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
YHR213W-B	Q8TGK1	YBR196C-A	YBR196C-A	150 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
YHR213W-B	Q8TGK1	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
YHR213W-B	Q8TGK1	YOR376W-A	YOR376W-A	156 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
YHR213W-B	Q8TGK1	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
YHR213W-B	Q8TGK1	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
YHR213W-B	Q8TGK1	snR81	snR81	201 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
YHR213W-B	Q8TGK1	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
YHR213W-B	Q8TGK1	YOR231C-A	YOR231C-A	201 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
YHR213W-B	Q8TGK1	YNL198C	YNL198C	303 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
YHR213W-B	Q8TGK1	tR(ACG)Q2	tR(ACG)Q2	74 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
YHR213W-B	Q8TGK1	YBL053W	YBL053W	375 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
YHR213W-B	Q8TGK1	YHR180C-B	YHR180C-B	105 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
YHR213W-B	Q8TGK1	YJL150W	YJL150W	303 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
YHR213W-B	Q8TGK1	snR56	snR56	88 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
YHR213W-B	Q8TGK1	YOR316C-A	YOR316C-A	210 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
YHR213W-B	Q8TGK1	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
YHR213W-B	Q8TGK1	YKL106C-A	YKL106C-A	120 nt		-1.44	□□□□□ -2.64
YHR213W-B	Q8TGK1	YOR309C	YOR309C	381 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
YHR213W-B	Q8TGK1	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
YHR213W-B	Q8TGK1	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
YHR213W-B	Q8TGK1	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
YHR213W-B	Q8TGK1	snR38	snR38	95 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
YHR213W-B	Q8TGK1	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
YHR213W-B	Q8TGK1	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
YHR213W-B	Q8TGK1	RPL41A	YDL184C	78 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
YHR213W-B	Q8TGK1	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
YHR213W-B	Q8TGK1	YGR151C	YGR151C	336 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
YHR213W-B	Q8TGK1	YOL083C-A	YOL083C-A	141 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
YHR213W-B	Q8TGK1	YNR077C	YNR077C	255 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
YHR213W-B	Q8TGK1	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
YHR213W-B	Q8TGK1	snR6	snR6	112 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
YHR213W-B	Q8TGK1	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-1.66	□□□□□ -2.68
YHR213W-B	Q8TGK1	snR47	snR47	99 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
YHR213W-B	Q8TGK1	YCL001W-B	YCL001W-B	255 nt		-1.75	□□□□□ -2.69
YHR213W-B	Q8TGK1	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-1.76	□□□□□ -2.69
YHR213W-B	Q8TGK1	SPG3	YDR504C	384 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
YHR213W-B	Q8TGK1	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		-1.77	□□□□□ -2.69
YHR213W-B	Q8TGK1	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-1.79	□□□□□ -2.7
YHR213W-B	Q8TGK1	snR73	snR73	106 nt		-1.8	□□□□□ -2.7
YHR213W-B	Q8TGK1	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-1.86	□□□□□ -2.71
YHR213W-B	Q8TGK1	YKL225W	YKL225W	348 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
YHR213W-B	Q8TGK1	YLR466C-B	YLR466C-B	117 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
YHR213W-B	Q8TGK1	YBL100W-C	YBL100W-C	120 nt		-1.9	□□□□□ -2.71
YHR213W-B	Q8TGK1	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
YHR213W-B	Q8TGK1	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-1.92	□□□□□ -2.72
YHR213W-B	Q8TGK1	YNL338W	YNL338W	159 nt		-1.94	□□□□□ -2.72
YHR213W-B	Q8TGK1	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
YHR213W-B	Q8TGK1	YNL337W	YNL337W	255 nt		-1.96	□□□□□ -2.72
YHR213W-B	Q8TGK1	tM(CAU)Q1	tM(CAU)Q1	76 nt		-2.01	□□□□□ -2.73
YHR213W-B	Q8TGK1	snR85	snR85	171 nt		-2.05	□□□□□ -2.74
YHR213W-B	Q8TGK1	Q0142	Q0142	177 nt		-2.08	□□□□□ -2.74
YHR213W-B	Q8TGK1	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-2.11	□□□□□ -2.75
YHR213W-B	Q8TGK1	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
YHR213W-B	Q8TGK1	YGL041C-B	YGL041C-B	183 nt		-2.14	□□□□□ -2.75
YHR213W-B	Q8TGK1	YNL103W-A	YNL103W-A	90 nt		-2.17	□□□□□ -2.76
YHR213W-B	Q8TGK1	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-2.18	□□□□□ -2.76

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80 ms