Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNNM3Q8NE01 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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