Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDKL3Q8IVW4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDKL3Q8IVW4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms