Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBE3BQ7Z3V4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms