Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms