Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SETXQ7Z333 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETXQ7Z333 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms