Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf139Q6ZV77 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms