Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC141Q6ZP82 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC141Q6ZP82 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC141Q6ZP82 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC141Q6ZP82 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC141Q6ZP82 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms