Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMIGD1Q6UXZ0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMIGD1Q6UXZ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms