Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED9Q6R2W3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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