Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5X2

YDR034W-B, Cysteine-rich and transmembrane domain-containing protein YDR034W-B, yeast

Predictions only

Length 51 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR24	snR24	89 nt		-8.59	□□□□□ -3.78
YDR034W-B	Q6Q5X2	YDL011C	YDL011C	324 nt		-8.6	□□□□□ -3.79
YDR034W-B	Q6Q5X2	ATP6	Q0085	780 nt		-8.62	□□□□□ -3.79
YDR034W-B	Q6Q5X2	YLR299C-A	YLR299C-A	93 nt		-8.67	□□□□□ -3.8
YDR034W-B	Q6Q5X2	YJL197C-A	YJL197C-A	282 nt		-8.7	□□□□□ -3.8
YDR034W-B	Q6Q5X2	tM(CAU)Q2	tM(CAU)Q2	78 nt		-8.73	□□□□□ -3.81
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR59	snR59	78 nt		-8.74	□□□□□ -3.81
YDR034W-B	Q6Q5X2	YPR039W	YPR039W	336 nt		-8.78	□□□□□ -3.81
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR9	snR9	187 nt		-8.79	□□□□□ -3.82
YDR034W-B	Q6Q5X2	YDR118W-A	YDR118W-A	117 nt		-8.83	□□□□□ -3.82
YDR034W-B	Q6Q5X2	YFL019C	YFL019C	354 nt		-8.84	□□□□□ -3.82
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR57	snR57	88 nt		-9.02	□□□□□ -3.85
YDR034W-B	Q6Q5X2	YBR109W-A	YBR109W-A	225 nt		-9.09	□□□□□ -3.86
YDR034W-B	Q6Q5X2	YBL071C	YBL071C	309 nt		-9.13	□□□□□ -3.87
YDR034W-B	Q6Q5X2	YMR013C-A	YMR013C-A	150 nt		-9.14	□□□□□ -3.87
YDR034W-B	Q6Q5X2	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		-9.16	□□□□□ -3.88
YDR034W-B	Q6Q5X2	YFL032W	YFL032W	321 nt		-9.17	□□□□□ -3.88
YDR034W-B	Q6Q5X2	Q0143	Q0143	153 nt		-9.18	□□□□□ -3.88
YDR034W-B	Q6Q5X2	YOR072W-B	YOR072W-B	162 nt		-9.27	□□□□□ -3.89
YDR034W-B	Q6Q5X2	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		-9.28	□□□□□ -3.89
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR58	snR58	96 nt		-9.31	□□□□□ -3.9
YDR034W-B	Q6Q5X2	YDR157W	YDR157W	402 nt		-9.32	□□□□□ -3.9
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR85	snR85	171 nt		-9.35	□□□□□ -3.91
YDR034W-B	Q6Q5X2	YCR095W-A	YCR095W-A	159 nt		-9.37	□□□□□ -3.91
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR78	snR78	87 nt		-9.37	□□□□□ -3.91
YDR034W-B	Q6Q5X2	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		-9.48	□□□□□ -3.93
YDR034W-B	Q6Q5X2	YGR174W-A	YGR174W-A	87 nt		-9.5	□□□□□ -3.93
YDR034W-B	Q6Q5X2	YOR381W-A	YOR381W-A	168 nt		-9.59	□□□□□ -3.94
YDR034W-B	Q6Q5X2	YIL115W-A	YIL115W-A	372 nt		-9.6	□□□□□ -3.95
YDR034W-B	Q6Q5X2	RPL39	YJL189W	156 nt		-9.71	□□□□□ -3.96
YDR034W-B	Q6Q5X2	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		-9.75	□□□□□ -3.97
YDR034W-B	Q6Q5X2	YER006C-A	YER006C-A	318 nt		-9.78	□□□□□ -3.98
YDR034W-B	Q6Q5X2	YBR296C-A	YBR296C-A	120 nt		-9.78	□□□□□ -3.98
YDR034W-B	Q6Q5X2	CSN9	YDR179C	489 nt		-9.82	□□□□□ -3.98
YDR034W-B	Q6Q5X2	YNL122C	YNL122C	348 nt		-9.82	□□□□□ -3.98
YDR034W-B	Q6Q5X2	YNL097C-B	YNL097C-B	123 nt		-9.86	□□□□□ -3.99
YDR034W-B	Q6Q5X2	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		-9.89	□□□□□ -3.99
YDR034W-B	Q6Q5X2	YKL096C-B	YKL096C-B	150 nt		-9.9	□□□□□ -3.99
YDR034W-B	Q6Q5X2	RPL41A	YDL184C	78 nt		-9.92	□□□□□ -4
YDR034W-B	Q6Q5X2	TSC3	YBR058C-A	243 nt		-9.93	□□□□□ -4
YDR034W-B	Q6Q5X2	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		-9.94	□□□□□ -4
YDR034W-B	Q6Q5X2	tV(UAC)Q	tV(UAC)Q	76 nt		-10.01	□□□□□ -4.01
YDR034W-B	Q6Q5X2	YDL114W-A	YDL114W-A	114 nt		-10.11	□□□□□ -4.03
YDR034W-B	Q6Q5X2	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		-10.16	□□□□□ -4.04
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR38	snR38	95 nt		-10.17	□□□□□ -4.04
YDR034W-B	Q6Q5X2	YDL159W-A	YDL159W-A	132 nt		-10.23	□□□□□ -4.05
YDR034W-B	Q6Q5X2	YGL041C	YGL041C	204 nt		-10.26	□□□□□ -4.05
YDR034W-B	Q6Q5X2	YOR102W	YOR102W	351 nt		-10.26	□□□□□ -4.05
YDR034W-B	Q6Q5X2	YLR434C	YLR434C	384 nt		-10.3	□□□□□ -4.06
YDR034W-B	Q6Q5X2	YDL016C	YDL016C	303 nt		-10.42	□□□□□ -4.08
YDR034W-B	Q6Q5X2	YEL014C	YEL014C	306 nt		-10.44	□□□□□ -4.08
YDR034W-B	Q6Q5X2	YGR151C	YGR151C	336 nt		-10.49	□□□□□ -4.09
YDR034W-B	Q6Q5X2	YOL164W-A	YOL164W-A	183 nt		-10.53	□□□□□ -4.1
YDR034W-B	Q6Q5X2	GIM4	YEL003W	336 nt		-10.6	□□□□□ -4.11
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR60	snR60	104 nt		-10.65	□□□□□ -4.11
YDR034W-B	Q6Q5X2	YAL063C-A	YAL063C-A	291 nt		-10.76	□□□□□ -4.13
YDR034W-B	Q6Q5X2	YGL188C-A	YGL188C-A	141 nt		-10.78	□□□□□ -4.14
YDR034W-B	Q6Q5X2	YNL324W	YNL324W	396 nt		-10.8	□□□□□ -4.14
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR56	snR56	88 nt		-10.81	□□□□□ -4.14
YDR034W-B	Q6Q5X2	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		-10.88	□□□□□ -4.15
YDR034W-B	Q6Q5X2	YNL028W	YNL028W	318 nt		-10.91	□□□□□ -4.16
YDR034W-B	Q6Q5X2	YBL053W	YBL053W	375 nt		-10.92	□□□□□ -4.16
YDR034W-B	Q6Q5X2	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-10.98	□□□□□ -4.17
YDR034W-B	Q6Q5X2	YKL118W	YKL118W	312 nt		-11.18	□□□□□ -4.2
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR48	snR48	113 nt		-11.19	□□□□□ -4.2
YDR034W-B	Q6Q5X2	SPG3	YDR504C	384 nt		-11.29	□□□□□ -4.22
YDR034W-B	Q6Q5X2	tL(UAA)Q	tL(UAA)Q	85 nt		-11.33	□□□□□ -4.22
YDR034W-B	Q6Q5X2	YHR175W-A	YHR175W-A	150 nt		-11.44	□□□□□ -4.24
YDR034W-B	Q6Q5X2	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		-11.49	□□□□□ -4.25
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR47	snR47	99 nt		-11.69	□□□□□ -4.28
YDR034W-B	Q6Q5X2	YDR034C-A	YDR034C-A	177 nt		-11.7	□□□□□ -4.28
YDR034W-B	Q6Q5X2	YBR131C-A	YBR131C-A	90 nt		-11.76	□□□□□ -4.29
YDR034W-B	Q6Q5X2	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		-11.85	□□□□□ -4.31
YDR034W-B	Q6Q5X2	YKL225W	YKL225W	348 nt		-11.86	□□□□□ -4.31
YDR034W-B	Q6Q5X2	YBL071C-B	YBL071C-B	99 nt		-11.89	□□□□□ -4.31
YDR034W-B	Q6Q5X2	HTL1	YCR020W-B	237 nt		-11.94	□□□□□ -4.32
YDR034W-B	Q6Q5X2	YGR122C-A	YGR122C-A	129 nt		-12.14	□□□□□ -4.35
YDR034W-B	Q6Q5X2	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		-12.16	□□□□□ -4.36
YDR034W-B	Q6Q5X2	YKL123W	YKL123W	381 nt		-12.19	□□□□□ -4.36
YDR034W-B	Q6Q5X2	YHL015W-A	YHL015W-A	84 nt		-12.22	□□□□□ -4.37
YDR034W-B	Q6Q5X2	SOM1	YEL059C-A	225 nt		-12.3	□□□□□ -4.38
YDR034W-B	Q6Q5X2	YPL152W-A	YPL152W-A	99 nt		-12.32	□□□□□ -4.38
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR52	snR52	92 nt		-12.32	□□□□□ -4.38
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR54	snR54	86 nt		-12.41	□□□□□ -4.4
YDR034W-B	Q6Q5X2	YPL038W-A	YPL038W-A	192 nt		-12.49	□□□□□ -4.41
YDR034W-B	Q6Q5X2	tS(GCU)Q1	tS(GCU)Q1	86 nt		-12.58	□□□□□ -4.42
YDR034W-B	Q6Q5X2	YAL037C-A	YAL037C-A	93 nt		-12.85	□□□□□ -4.47
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR40	snR40	97 nt		-12.91	□□□□□ -4.48
YDR034W-B	Q6Q5X2	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		-12.96	□□□□□ -4.48
YDR034W-B	Q6Q5X2	YOR225W	YOR225W	330 nt		-13.09	□□□□□ -4.5
YDR034W-B	Q6Q5X2	YNR025C	YNR025C	360 nt		-13.23	□□□□□ -4.53
YDR034W-B	Q6Q5X2	YLR294C	YLR294C	330 nt		-13.4	□□□□□ -4.55
YDR034W-B	Q6Q5X2	YDR183C-A	YDR183C-A	258 nt		-13.48	□□□□□ -4.57
YDR034W-B	Q6Q5X2	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		-13.83	□□□□□ -4.62
YDR034W-B	Q6Q5X2	YOR302W	YOR302W	78 nt		-13.89	□□□□□ -4.63
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR64	snR64	101 nt		-13.96	□□□□□ -4.64
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR65	snR65	100 nt		-14.15	□□□□□ -4.67
YDR034W-B	Q6Q5X2	YNL277W-A	YNL277W-A	189 nt		-14.28	□□□□□ -4.7
YDR034W-B	Q6Q5X2	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		-14.62	□□□□□ -4.75
YDR034W-B	Q6Q5X2	snR62	snR62	100 nt		-14.9	□□□□□ -4.79

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms