Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1Q6PKG0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms