Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H3F3CQ6NXT2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms