Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM236Q5W0B7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM236Q5W0B7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms