Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NHSL1Q5SYE7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NHSL1Q5SYE7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms