Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RPL39P5Q59GN2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms