Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSP90AB3PQ58FF7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HSP90AB3PQ58FF7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms