Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP24-1Q3LI83 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP24-1Q3LI83 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms