Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ME3Q16798 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ME3Q16798 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ME3Q16798 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ME3Q16798 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ME3Q16798 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ME3Q16798 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ME3Q16798 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ME3Q16798 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ME3Q16798 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
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