Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2B3Q16720 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B3Q16720 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
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