Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms