Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASIC2Q16515 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASIC2Q16515 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms