Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKN2Q16513 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PKN2Q16513 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms