Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN9AQ15858 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN9AQ15858 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms